Release 7.8

Silent a few byte-compiler warnings.

* org.el (org-block-regexp)
(org-heading-keyword-regexp-format)
(org-heading-keyword-maybe-regexp-format): Move up to keep the
byte-compiler happy.

* org-special-blocks.el (org-html): Require 'org-html.
(org-open-par, org-close-par-maybe): Declare as functions.

* ob.el (org-reduce): Declare as a function.
(org-current-export-file): Declare.

* ob-ref.el (org-babel-update-intermediate): Make a defvar.

`org-agenda-do-tree-to-indirect-buffer': rewrite of the docstring.

Maintain stable window config when `org-agenda-follow-indirect' is set.

* org-agenda.el (org-agenda-do-tree-to-indirect-buffer): New
function.
(org-agenda-tree-to-indirect-buffer): Use the new function.

TINYCHANGE

Without this change, `org-agenda-follow-indirect' tends to cause the
window configration to bounce around chaotically as you move from item
to item.

Improving bug reporting documentation

Hi Bastien and others,

Lately I have been seeing a lot of bug reports sent using the
org-submit-bug-report. The reporter usually reports the bug from a
session they have been using with their full blown customisations. And
often they are requested to reproduce the bug with emacs -Q. So I
thought it would be easier if the manual mentioned this little detail.
A patch is attached.

Hope this helps.

PS: I marked the patch as TINY CHANGE.

org-lparse.el: don't need to be executable.

org-agenda.el: small indentation fix.

Merge branches 'master' and 'master' of orgmode.org:org-mode

Fix bug when inserting the output of a custom function for the pre/postamble.

* org-html.el (org-export-as-html): Fix bug when inserting the
output of a custom function for the pre/postamble.

Thanks to Bill Jackson for raising a related issue.

org-odt.el: Don't crash if htmlfontify is not available

* lisp/org-odt.el (org-odt-format-source-code-or-example): Try
loading htmlfontify safely.

Require htmlfontify.el only if emacs-version is greater than 23.2.

* org-odt.el (require): Require htmlfontify.el only if
emacs-version is greater than 23.2.

Thanks to Martyn Jago for reporting this.

Use the default face instead of fancy colors.

* org-faces.el (org-agenda-calendar-event)
(org-agenda-calendar-sexp): Use the default face.

Thanks to Detlef Steuer for reporting this.

Fix a few docstrings.

Thanks to Paul Eggert for fixing this in Emacs.

org.texi: Corrections to ODT section

Thanks to Christian Moe for proof-reading the manual and suggesting
corrections.

fixed regexp when resolving noweb references

* lisp/ob.el (org-babel-expand-noweb-references): Fixed regexp.
* testing/lisp/test-ob.el (test-ob/noweb-expansion): Test both named
  code block and noweb-ref header argument references.

Completion of remapping for Outline functions

* lisp/org.el Key bindings: remap the Outline functions from
`outline-mode-prefix-map' where possible.

Correct html export of todo keywords

* org-html.el (org-export-as-html): Apply
  `org-export-html-get-todo-kwd-class-name' to the class
  attribute of the todo-keyword span tag, not to its text content.

The problem was that special characters in todo keywords were being
replaced by underscore. This was meant to happen to the class
attributes set around them.

TINYCHANGE

This only swaps two arguments to a concat.

Add faces for "calendar events" (active timestamps, or S-expressions).

* org-agenda.el (org-agenda-get-timestamps)
(org-agenda-get-sexps): Use face for highlighting "calendar"
events.

* org-faces.el: Add faces `org-agenda-calendar-event' and
`org-agenda-calendar-sexp'.

Timestamps: Fix org-schedule and org-deadline with absolute time arguments

* lisp/org.el (org-add-planning-info): Treat absolute time too.

TINYCHANGE

* org-table.el (org-table-transpose-table-at-point): Don't use ̀remove-if-not'.

* org-table.el (org-table-transpose-table-at-point): Don't use
̀remove-if-not'.

Thanks to Achim Gratz for spotting this.

 org-clock.el: Check the clock buffer is existing when clocking out.

* org-clock.el (org-clock-out-if-current): Check the clock
buffer is existing.

TINYCHANGE

Fix marker in no buffer error for task state change in an indirect buffer

* lisp/org-clock.el (org-clock-out-if-current): Fix marker in no buffer error
  for task state change in an indirect buffer

org-clock-out-when-current was enhanced in 098cf35 (Clock: Clock out
when done also in indirect buffers, 2009-03-23) to handle indirect
buffers.

This enhancement uses (buffer-base-buffer (org-clocking-buffer)) but
when not clocking (org-clocking-buffer) returns nil - so
buffer-base-buffer returns the base buffer of the current buffer which
is never nil.  This leads to marker in no buffer errors trying to stop
the clock when it is not running.

Now we explicitly check up front that the clock is running before
any other conditions that lead to stopping the clock.

Bugfix open 1 link from list; doc more link types

* doc/org.texi (External links): Document the link types file+sys and
file+emacs, slightly narrow used page width.
* lisp/org.el (org-offer-links-in-entry): Make list when assigning a
single link.

"M-1 C-c C-o" or (org-open-at-point 1) or (org-offer-links-in-entry 1)
on a headline followed by two links enters Lisp error.  Both changes
are remainders of the commit release_6.33f-189-g3e0c61d.

remove #+name and #+result hiding

Given that arbitrary regions may already be hidden using a drawer the
ability to hide any named entity is redundant.  In addition the name
based hiding does not mix well with other keywords.

Thanks to Nicolas Goaziou for raising this issue and suggesting the
removal of #+name based hiding.

faster method of collecting continuing code blocks

* lisp/ob.el (org-babel-expand-noweb-references): Rather than collect
  the info from *every* block in the current buffer, simply regexp
  search for those blocks which appear to match the continued source
  name.

wrap code block results in drawers rather than blocks

* lisp/ob.el (org-babel-insert-result): Do not examplize wrapped
  scalar results, simply wrap them.
  (org-babel-result-end): Find the end of results wrapped in a RESULTS
  drawer.

Make `org-todo-yesterday' call `org-agenda-todo-yesterday' if necessary.

* org.el (org-todo-yesterday): When called from the agenda,
use `org-agenda-todo-yesterday' instead.

New command: `org-table-transpose-table-at-point'.

* org-table.el (org-table-transpose-table-at-point): New
command.

Thanks to Juan Pechiar for this function.

Rewrite of contrib/lisp/org-velocity.el.

From the author: "This is a rewrite of Org-Velocity for speed. Delays due
to file size should no longer be perceptible. I have also added in-line
previews of entry contents and dropped support for Org-Remember."

New option `org-export-html-headline-anchor-format'.

* org-html.el (org-export-html-headline-anchor-format): New
option.
(org-html-level-start): Use the new option.

This was requested by Alan L Tyree.

Add a commentary: how to test org-e-latex.el.

Rename EXPERIMENTAL/org-latex.el to EXPERIMENTAL/org-e-latex.el.

This prevents a namespace conflict with lisp/org-latex.el.  By
convention, new exporters in EXPERIMENTAL/ will share the org-e-*
prefix.

Fix quoting in org-agenda-with-point-at-orig-entry.

* org-agenda.el (org-agenda-with-point-at-orig-entry): Small
bugfix.

TINYCHANGE

Minor example fix.

Thanks to Dov Grobgeld for spotting this.

Special blocks: Make well-formed HTML

* org-special-blocks.el
(org-special-blocks-convert-html-special-cookies): Close paragraph
before opening or closing the <div>, and open paragraph after. Also
changed newline placement to be the same as for other blocks.

The problem was that special blocks did not produce well-formed HTML
because they  wrapped the opening and closing
<div> tags in <p> tags.

TINYCHANGE

This patch only borrows a few lines from the handling of `CENTER'
blocks in org-export-as-html.

New option `org-table-formula-field-format'.

Format for fields which contain the result of a formula.
For example, using \"~%s~\" will display the result within tilde
characters.  Beware that modifying the display can prevent the
field from being used in another formula.

Based on an idea of Dov Grobgeld.

Merge branch 'master' of orgmode.org:org-mode

Make the function `org-program-exists' work on osx.

* org-clock.el (org-program-exists): Make the function
compatible with darwin systems.

Code indentation fix (tabify)

Avoid erroneous normalization of bracket link parts

* org-exp.el (org-export-normalize-links): Mark bracket links before
normalization to avoid erroneous normalization of bracket link parts.

This fixes a bug reported by M. Bauer at
<http://thread.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/49756> and allows proper
normalization of bracket links with a link in the query part, e.g.

[[http://example.tld?q=http://example.tld][Example]]

org.texi (Custom Table Styles - An Illustration): New node

Also improve various menus.

org.texi (Validating OpenDocument XML): New node

org-odt.el (org-export-odt-schema-dir): Modified

Makefile (PKG_FILES) : Include etc/

Also fix all byte-compiler warnings in org-lparse.el and org-odt.el.

Add string input variables to ob-octave.el. Add tests for ob-octave.el

org.texi: Improve ODT section

org.texi: Improve ODT section

org.texi: Improve ODT section

org.texi: Refine ODT section

doc/org.texi: Update ODT section

Add copyright and license info for files in etc/styles/

org-odt.el: Misc changes to reflect change in dir layout

* lisp/org-odt.el (org-odt-data-dir): Removed.
(org-odt-styles-dir, org-export-odt-schema-dir): New
variables.

Makefile (LISPF): Add org-lparse.el and org-odt.el

Also update dependencies.

org-exp.el: s/OpenDocumentText/OpenDocument Text/

org.el (org-modules): odt is no longer a contrib module

Move org-lparse.el and org-odt.el to the main lisp dir

Move contrib/odt/styles/*.xml to etc/styles

Delete org-export.el, org-mw.el and org-mm.el.

org-export.el conflicts with contrib/lisp/org-export.el and the
two org-mw.el org-mm.el don't work without it.  A rewrite of these
experimental exporters using Nicolas' org-export.el is necessary.

Revert "Rename EXPERIMENTAL/org-latex.el to EXPERIMENTAL/org-latex-old.el"

This reverts commit a75e29ca5bc14734c760823c28540730f7a6eff8.

UTILITIES/man*: Fix bug: don't insert </style>

Rename EXPERIMENTAL/org-latex.el to EXPERIMENTAL/org-latex-old.el

This is necessary to prepare release 7.8.

Merge branch 'master' of orgmode.org:org-mode

Add the binding for org-table-wrap-region to orgtbl-mode

EXPERIMENTAL/org-latex: Fix bug in table transcoding

* EXPERIMENTAL/org-latex.el (org-latex-table): Fix confusion between
  communication channel and table information plists.

contrib/lisp/org-export: Extract more properties from tables

* contrib/lisp/org-export.el (org-export-table-format-info): Extract
column width and and row groups.

Fix typos (already fixed in Emacs trunk.)

Thanks to Juanma Barranquero for spotting and fixing them in Emacs.

Fix bug in org-capture file+datetree+promt target type

* lisp/org-capture.el (org-capture-set-target-location): Set the capture
default time also to the prompt time.

In the file+datetree+promt target type, the user is being asked for a
date, where to file an entry.  In the template, there can the escape
placeholders for active and inactive time stamps.  So far, these were
filled with todays date.  This patch changes this behavior, so that
also at %t and %u escaped, the date entered at the prompt will be
used.

Reported by Erik Hetzner.

org-export: Cleanup #+name and #+results

* lisp/org-exp.el (org-export-res/src-name-cleanup): Remove #+name and
  #+results lines during preprocess.

Now Babel doesn't handle anymore those keywords cleanup (as #+name may
be used for other thing than code evaluation), that task is moved to
org-export.el.  See commit 25a0a0212193ecc5e910696301b3a64a51f837e0.

org.texi: Fix typos.

Thanks to Paul Eggert for spotting this and fixing it in Emacs.

contrib/lisp/org-element: Re-order a function within the file

contrib/lisp/org-element: Do not map function to ignored elements or objects

* contrib/lisp/org-element.el (org-element-map): In an export
  situation, only map function on included elements or objects.

contrib/lisp/org-export: Fix headline numbering

* contrib/lisp/org-export.el (org-export-persistent-properties-list):
  Remove unused persistent properties.
(org-export-initialize-persistent-properties): Delegate headline
  numbering alist to `org-export-collect-headline-numbering'.
(org-export-collect-headline-numbering): New function.
(org-export-update-info): Remove part relative to headline numbering.
(org-export-get-headline-number): Use new `:headline-numbering' to get
  current headline number.

Headline numbering is not done on demand anymore, but built once and
for all at the beginning of the export process, and stored in an
alist, accessible through the `:headline-numbering' property in the
communication channel.

EXPERIMENTAL/org-latex: Small refactoring.

* EXPERIMENTAL/org-latex.el (org-latex-footnote-reference): Small
  refactoring.

fix compiler warnings in ob-picolisp

* lisp/ob-picolisp.el (ob-comint): Required.
  (comint): Required.
  (cl): Required.
  (run-picolisp): Declared.
  (org-babel-execute:picolisp): Capture free variable, and replace
  function from cl-extra with core function.

moving ob-picolisp into the core

Thanks to Thorsten Jolitz for contributing support for this new
language.

* Makefile (LISPF): Add ob-picolisp to the Makefile.
* contrib/babel/langs/ob-picolisp.el: Remove from contrib.
* lisp/ob-picolisp.el: Add to core lisp directory.
* lisp/org.el (org-babel-load-languages): Add Pico Lisp to the list of
  supported code block languages.

improved warnings of bibtex errors during multi-headline export

* lisp/org-bibtex.el (org-bibtex): Now catches bibtex errors and
  directs the user to the location of the error.

EXPERIMENTAL/org-latex: LaTeX back-end for generic exporter

* EXPERIMENTAL/org-latex.el (org-latex-option-alist,
  org-latex-default-class, org-latex-classes
  org-latex-inputenc-alist, org-latex-date-format,
  org-latex-title-command, org-latex-format-headline-function, org-latex-emphasis-alist,
  org-latex-footnote-separator, org-latex-active-timestamp-format,
  org-latex-inactive-timestamp-format,
  org-latex-diary-timestamp-format, org-latex-image-default-option,
  org-latex-default-figure-position, org-latex-inline-image-extensions,
  org-latex-default-table-environment, org-latex-tables-centered,
  org-latex-tables-verbatim, org-latex-table-caption-above,
  org-latex-format-drawer-function,
  org-latex-format-inlinetask-function, org-latex-listings, org-latex-listings-langs,
  org-latex-listings-options, org-latex-minted-langs,
  org-latex-minted-options, org-latex-quotes,
  org-latex-custom-lang-environments): New variables.
(org-latex--caption/label-string, org-latex--guess-inputenc,
  org-latex--find-verb-separator, org-latex--make-option-string,
  org-latex--quotation-marks, org-latex--wrap-label,
  org-latex-template, org-latex-center-block, org-latex-drawer,
  org-latex-dynamic-block, org-latex-emphasis, org-latex-entity,
  org-latex-example-block, org-latex-export-snippet,
  org-latex-export-block, org-latex-fixed-width,
  org-latex-footnote-reference, org-latex-headline,
  org-latex-horizontal-rule, org-latex-inline-src-block,
  org-latex-inlinetask, org-latex-item, org-latex-keyword,
  org-latex-latex-environment, org-latex-latex-fragment,
  org-latex-line-break, org-latex-link--inline-image, org-latex-link,
  org-latex-macro, org-latex-paragraph, org-latex-plain-list,
  org-latex-plain-text, org-latex-property-drawer,
  org-latex-quote-block, org-latex-quote-section,
  org-latex-radio-target, org-latex-special-block,
  org-latex-src-block, org-latex-statistics-cookie,
  org-latex-subscript, org-latex-superscript,
  org-latex-table--format-string, org-latex-table--align-string,
  org-latex-table, org-latex-target, org-latex-time-stamp,
  org-latex-verbatim, org-latex-verse-block): New functions.

contrib/lisp/org-export: Fix visibility influence on list parsing

* contrib/lisp/org-export.el (org-export-with-current-buffer-copy):
  Full invisibility prevents `current-column' from returning useful
  values.  Thus, keep visibility related text-properties and set
  `buffer-invisibility-spec' to nil.

note that colnames behavior may differ across languages

* doc/org.texi (colnames): Note that colnames behavior may differ
  across languages.

tests for the colnames header argument

org-agenda.el (org-agenda-dim-blocked-tasks): Fix typo.

* org-agenda.el (org-agenda-dim-blocked-tasks): Fix typo.

Thanks to Paul Eggert for spotting this and fixing it in Emacs trunk.

org.texi (Weekly/daily agenda, Agenda commands): Fix typos.

* org.texi (Weekly/daily agenda, Agenda commands): Fix typos.

Thanks to Paul Eggert for spotting this.

Fix typo fixed in Emacs trunk.

* ob.el (org-babel-execute-src-block): Fix typo.

Thanks to Juanma Barranquero for spotting this.

Fix typos fixed in Emacs trunk.

* org-freemind.el (org-freemind-write-mm-buffer): Fix typo.

* org-colview.el (org-columns-edit-value) (org-columns-next-allowed-value):
  Fix typos.

* org-bibtex.el (org-bibtex-autogen-keys): Fix typo.

* org-clock.el (org-clock-special-range): Fix typo.

Thanks to Paul Eggert for these fixes.

org.el: Fix two typos in docstrings.

* org.el (org-link-unescape, org-link-unescape-compound): Fix two
  typos in docstrings.

* lisp/ob-R.el: Added tikzDevice support.

contrib/lisp/org-export: Fix a docstring.

* contrib/lisp/org-export.el (org-export-option-alist): Fix docstring.

contrib/lisp/org-export.el: Fix misleading comments about transcoders

* contrib/lisp/org-export.el: Fix misleading comments about transcoders.

org-babel-exp-lob-one-liners should not parse the entire buffer.

The org-babel-exp-lob-one-liners search "call" pattern through the entire
buffer instead of the region given as arguments.

contrib/org-export: Generic Export Engine For Org

* contrib/lisp/org-export.el (org-export-collect-options,
  org-export-parse-option-keyword, org-export-get-subtree-options,
  org-export-get-inbuffer-options, org-export-get-global-options,
  org-export-initial-options, org-export-confirm-letbind,
  org-export-install-letbind-maybe,
  org-export-initialize-persistent-properties,
  org-export-use-select-tags-p, org-export-get-min-level,
  org-export-get-point-max, org-export-update-info,
  org-export-set-property, org-export-data,
  org-export-secondary-string, org-export-skip-p,
  org-export-interpret-p, org-export-filter-apply-functions,
  org-export-as, org-export-to-buffer, org-export-get-relative-level,
  org-export-get-headline-number, org-export-number-to-roman,
  org-export-first-sibling-p, org-export-last-sibling-p,
  org-export-included-file, org-export-get-file-contents,
  org-export-parse-included-file, org-export-solidify-link-text,
  org-export-get-coderef-format, org-export-inline-image-p,
  org-export-resolve-fuzzy-link, org-export-expand-macro,
  org-export-handle-code, org-export-table-format-info,
  org-export-clean-table, org-export-get-headlines,
  org-export-collect-elements, org-export-collect-tables,
  org-export-get-figures, org-export-collect-listings): New functions.
(org-export-max-depth, org-export-option-alist,
  org-export-special-keywords, org-export-persistent-properties-list,
  org-export-persistent-properties, org-export-with-archived-trees,
  org-export-with-author, org-export-with-creator,
  org-export-creator-string, org-export-with-drawers,
  org-export-with-email, org-export-with-emphasize,
  org-export-exclude-tags, org-export-with-fixed-width,
  org-export-with-footnotes, org-export-headline-levels,
  org-export-default-language, org-export-preserve-breaks,
  org-export-with-entities, org-export-with-priority,
  org-export-with-section-numbers, org-export-select-tags,
  org-export-with-special-strings, org-export-with-sub-superscripts,
  org-export-with-toc, org-export-with-tables, org-export-with-tags,
  org-export-with-tasks, org-export-time-stamp-file,
  org-export-with-timestamps, org-export-with-todo-keywords,
  org-export-allow-BIND, org-export-snippet-translation-alist,
  org-export-filter-parse-tree-functions,
  org-export-filter-final-output-functions,
  org-export-filter-plain-text-functions,
  org-export-filter-center-block-functions,
  org-export-filter-drawer-functions,
  org-export-filter-dynamic-block-functions,
  org-export-filter-headline-functions,
  org-export-filter-inlinetask-functions,
  org-export-filter-plain-list-functions,
  org-export-filter-item-functions,
  org-export-filter-comment-functions,
  org-export-filter-comment-block-functions,
  org-export-filter-example-block-functions,
  org-export-filter-export-block-functions,
  org-export-filter-fixed-width-functions,
  org-export-filter-footnote-definition-functions,
  org-export-filter-horizontal-rule-functions,
  org-export-filter-keyword-functions,
  org-export-filter-latex-environment-functions,
  org-export-filter-babel-call-functions,
  org-export-filter-paragraph-functions,
  org-export-filter-property-drawer-functions,
  org-export-filter-quote-block-functions,
  org-export-filter-quote-section-functions,
  org-export-filter-special-block-functions,
  org-export-filter-src-block-functions,
  org-export-filter-table-functions,
  org-export-filter-verse-block-functions,
  org-export-filter-emphasis-functions,
  org-export-filter-entity-functions,
  org-export-filter-export-snippet-functions,
  org-export-filter-footnote-reference-functions,
  org-export-filter-inline-babel-call-functions,
  org-export-filter-inline-src-block-functions,
  org-export-filter-latex-fragment-functions,
  org-export-filter-line-break-functions,
  org-export-filter-link-functions,
  org-export-filter-macro-functions,
  org-export-filter-radio-target-functions,
  org-export-filter-statistics-cookie-functions,
  org-export-filter-subscript-functions,
  org-export-filter-superscript-functions,
  org-export-filter-target-functions,
  org-export-filter-time-stamp-functions,
  org-export-filter-verbatim-functions): New variables.

org-odt.el: Export TOC max-level information.

The TOC max level which could be specified by user is lost during the
export operation. However, this information could be useful in particular
with the ODT exporter. So if another script work on the ODT afterward and
ask to re-compute the TOC, the new TOC will keep this max level.

TINYCHANGE.

org-odt.el: Fix performance issue on manifest file writing

* contrib/lisp/org-odt.el (org-odt-write-manifest-file): Don't
use write-region.

The org-odt-write-manifest-file function take too much time -
several seconds for 164 files. This patch provides a cheaper
implementation (hundredths of a seconds for 164 files).

Original patch by Jérémy Compostella
<jeremy.compostella@gmail.com>.  Rewritten by Jambunathan K to
minimize the actual number of lines changed.

TINYCHANGE.

From http://www.mail-archive.com/emacs-orgmode@gnu.org/msg49248.html
I'm currently generating a road book for a trip from different
Org-Mode file and other data. It results in a 13 thousands
lines Org-Mode file and I have some performance issues. Using
the ELP package, I isolated the two main bottlenecks.

One is in org-odt : the org-odt-write-manifest-file function
is called once and takes 5.546672 seconds to write a 167 lines
file. I rewrote this function and now it takes 0.01606 seconds
to write the same file.

org-element: Fix parsing of src-block switches when there is more than one

* contrib/lisp/org-element.el (org-element-src-block-parser): Previous
  regexp would only get the last switch if more than one were
  provided.

Merge branch 'master' of orgmode.org:org-mode

Remove clocking information when preparing a clone

* org.el (org-clone-subtree-with-time-shift): Remove clocking
information and empty drawers when preparing a clone.

Fixes a regression introduced by
516b2fbb8763788585ac6a9f60ad7d51c4b0aab3, reported by Bernt Hansen in
http://article.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/49385

* doc/org.texi: Augmented discussion of babel property inheritance. Put footnote outside sentence ending period.

Merge branch 'master' of orgmode.org:org-mode

Require parse-time for `org-read-date-get-relative'

org-odt.el: Fix a bug wrt label references

* contrib/lisp/org-odt.el (org-odt-fixup-label-references)
(org-export-odt-preprocess-label-references): Modified.

Workaround for issue reported here:
http://lists.gnu.org/archive/html/emacs-orgmode/2011-11/msg00773.html

no longer strip code and result names during block preprocessing

* lisp/ob-exp.el: Don't add `org-exp-res/src-name-cleanup' to
  `org-export-blocks-postblock-hook'.