Release 7.8.02

Merge branch 'master' of orgmode.org:org-mode

Makefile: include etc/* in the distribution.

fixed bug in parsing of arguments to code block references

* lisp/ob-ref.el (org-babel-ref-split-args): Now uses
  `org-babel-balanced-split'.
* testing/lisp/test-ob.el (test-ob/splitting-variable-lists-in-references):
  Test new working behavior.

Update website to show 7.8.01 as current release

Merge branch 'maint'

Release 7.8.01

UTILITIES: Use a separate css for the HTML manuals.

org-html.el: fix docstrings and the pre/postamble inserting.

* org-html.el (org-export-html-preamble)
(org-export-html-postamble): Fix docstrings.
(org-export-as-html): Insert the string used by a custom
function for `org-export-html-pre/postamble'.

The documentation is now in sync with the behavior: a custom
function for `org-export-html-pre/postamble' takes no argument,
and its value is inserted as a string.  Before that, users had
to use (insert ...) constructs to insert content in the preamble
through a custom function.

Thanks to Bill Jackson for spotting these inconsistencies.

Org manual: Fix double-spaces at the end of sentences

Org manual: Fix double-spaces at the end of sentences

* doc/org.texi: End sentences with two spaces.

>From 19e39b67f4a8dbee3f1015f636fac4f77e59d3c2 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Julian Gehring <julian.gehring@googlemail.com>
Date: Mon, 12 Dec 2011 19:19:20 +0100
Subject: [PATCH] Org manual: Fix double-spaces at the end of sentences

* doc/org.texi: End sentences with two spaces.

Orgcard: Correct markup in 'Timestamps' section

Orgcard: Correct markup in 'Timestamps' section

* doc/orgcard.tex: Correct one markup in 'Timestamps' section

>From 756e4eb6aca0e1b72f8fa55537005d2b617b83f8 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Julian Gehring <julian.gehring@googlemail.com>
Date: Mon, 12 Dec 2011 12:29:46 +0100
Subject: [PATCH] Orgcard: Correct markup in 'Timestamps' section

* doc/orgcard.tex: Correct one markup in 'Timestamps' section

Merge branch 'master' of orgmode.org:org-mode

Revert "Fix bug when inserting the output of a custom function for the pre/postamble."

This reverts commit 701830d5a2681ba0ff2e5112fbd4279eb958801a.

Update website to show 7.8 as current release

Merge branch 'maint'

Release 7.8

Silent a few byte-compiler warnings.

* org.el (org-block-regexp)
(org-heading-keyword-regexp-format)
(org-heading-keyword-maybe-regexp-format): Move up to keep the
byte-compiler happy.

* org-special-blocks.el (org-html): Require 'org-html.
(org-open-par, org-close-par-maybe): Declare as functions.

* ob.el (org-reduce): Declare as a function.
(org-current-export-file): Declare.

* ob-ref.el (org-babel-update-intermediate): Make a defvar.

`org-agenda-do-tree-to-indirect-buffer': rewrite of the docstring.

Maintain stable window config when `org-agenda-follow-indirect' is set.

* org-agenda.el (org-agenda-do-tree-to-indirect-buffer): New
function.
(org-agenda-tree-to-indirect-buffer): Use the new function.

TINYCHANGE

Without this change, `org-agenda-follow-indirect' tends to cause the
window configration to bounce around chaotically as you move from item
to item.

Improving bug reporting documentation

Hi Bastien and others,

Lately I have been seeing a lot of bug reports sent using the
org-submit-bug-report. The reporter usually reports the bug from a
session they have been using with their full blown customisations. And
often they are requested to reproduce the bug with emacs -Q. So I
thought it would be easier if the manual mentioned this little detail.
A patch is attached.

Hope this helps.

PS: I marked the patch as TINY CHANGE.

org-lparse.el: don't need to be executable.

org-agenda.el: small indentation fix.

Merge branches 'master' and 'master' of orgmode.org:org-mode

Fix bug when inserting the output of a custom function for the pre/postamble.

* org-html.el (org-export-as-html): Fix bug when inserting the
output of a custom function for the pre/postamble.

Thanks to Bill Jackson for raising a related issue.

org-odt.el: Don't crash if htmlfontify is not available

* lisp/org-odt.el (org-odt-format-source-code-or-example): Try
loading htmlfontify safely.

Require htmlfontify.el only if emacs-version is greater than 23.2.

* org-odt.el (require): Require htmlfontify.el only if
emacs-version is greater than 23.2.

Thanks to Martyn Jago for reporting this.

Use the default face instead of fancy colors.

* org-faces.el (org-agenda-calendar-event)
(org-agenda-calendar-sexp): Use the default face.

Thanks to Detlef Steuer for reporting this.

Fix a few docstrings.

Thanks to Paul Eggert for fixing this in Emacs.

org.texi: Corrections to ODT section

Thanks to Christian Moe for proof-reading the manual and suggesting
corrections.

fixed regexp when resolving noweb references

* lisp/ob.el (org-babel-expand-noweb-references): Fixed regexp.
* testing/lisp/test-ob.el (test-ob/noweb-expansion): Test both named
  code block and noweb-ref header argument references.

Completion of remapping for Outline functions

* lisp/org.el Key bindings: remap the Outline functions from
`outline-mode-prefix-map' where possible.

Correct html export of todo keywords

* org-html.el (org-export-as-html): Apply
  `org-export-html-get-todo-kwd-class-name' to the class
  attribute of the todo-keyword span tag, not to its text content.

The problem was that special characters in todo keywords were being
replaced by underscore. This was meant to happen to the class
attributes set around them.

TINYCHANGE

This only swaps two arguments to a concat.

Add faces for "calendar events" (active timestamps, or S-expressions).

* org-agenda.el (org-agenda-get-timestamps)
(org-agenda-get-sexps): Use face for highlighting "calendar"
events.

* org-faces.el: Add faces `org-agenda-calendar-event' and
`org-agenda-calendar-sexp'.

Timestamps: Fix org-schedule and org-deadline with absolute time arguments

* lisp/org.el (org-add-planning-info): Treat absolute time too.

TINYCHANGE

* org-table.el (org-table-transpose-table-at-point): Don't use ̀remove-if-not'.

* org-table.el (org-table-transpose-table-at-point): Don't use
̀remove-if-not'.

Thanks to Achim Gratz for spotting this.

 org-clock.el: Check the clock buffer is existing when clocking out.

* org-clock.el (org-clock-out-if-current): Check the clock
buffer is existing.

TINYCHANGE

Fix marker in no buffer error for task state change in an indirect buffer

* lisp/org-clock.el (org-clock-out-if-current): Fix marker in no buffer error
  for task state change in an indirect buffer

org-clock-out-when-current was enhanced in 098cf35 (Clock: Clock out
when done also in indirect buffers, 2009-03-23) to handle indirect
buffers.

This enhancement uses (buffer-base-buffer (org-clocking-buffer)) but
when not clocking (org-clocking-buffer) returns nil - so
buffer-base-buffer returns the base buffer of the current buffer which
is never nil.  This leads to marker in no buffer errors trying to stop
the clock when it is not running.

Now we explicitly check up front that the clock is running before
any other conditions that lead to stopping the clock.

Bugfix open 1 link from list; doc more link types

* doc/org.texi (External links): Document the link types file+sys and
file+emacs, slightly narrow used page width.
* lisp/org.el (org-offer-links-in-entry): Make list when assigning a
single link.

"M-1 C-c C-o" or (org-open-at-point 1) or (org-offer-links-in-entry 1)
on a headline followed by two links enters Lisp error.  Both changes
are remainders of the commit release_6.33f-189-g3e0c61d.

remove #+name and #+result hiding

Given that arbitrary regions may already be hidden using a drawer the
ability to hide any named entity is redundant.  In addition the name
based hiding does not mix well with other keywords.

Thanks to Nicolas Goaziou for raising this issue and suggesting the
removal of #+name based hiding.

faster method of collecting continuing code blocks

* lisp/ob.el (org-babel-expand-noweb-references): Rather than collect
  the info from *every* block in the current buffer, simply regexp
  search for those blocks which appear to match the continued source
  name.

wrap code block results in drawers rather than blocks

* lisp/ob.el (org-babel-insert-result): Do not examplize wrapped
  scalar results, simply wrap them.
  (org-babel-result-end): Find the end of results wrapped in a RESULTS
  drawer.

Make `org-todo-yesterday' call `org-agenda-todo-yesterday' if necessary.

* org.el (org-todo-yesterday): When called from the agenda,
use `org-agenda-todo-yesterday' instead.

New command: `org-table-transpose-table-at-point'.

* org-table.el (org-table-transpose-table-at-point): New
command.

Thanks to Juan Pechiar for this function.

Rewrite of contrib/lisp/org-velocity.el.

From the author: "This is a rewrite of Org-Velocity for speed. Delays due
to file size should no longer be perceptible. I have also added in-line
previews of entry contents and dropped support for Org-Remember."

New option `org-export-html-headline-anchor-format'.

* org-html.el (org-export-html-headline-anchor-format): New
option.
(org-html-level-start): Use the new option.

This was requested by Alan L Tyree.

Add a commentary: how to test org-e-latex.el.

Rename EXPERIMENTAL/org-latex.el to EXPERIMENTAL/org-e-latex.el.

This prevents a namespace conflict with lisp/org-latex.el.  By
convention, new exporters in EXPERIMENTAL/ will share the org-e-*
prefix.

Fix quoting in org-agenda-with-point-at-orig-entry.

* org-agenda.el (org-agenda-with-point-at-orig-entry): Small
bugfix.

TINYCHANGE

Minor example fix.

Thanks to Dov Grobgeld for spotting this.

Special blocks: Make well-formed HTML

* org-special-blocks.el
(org-special-blocks-convert-html-special-cookies): Close paragraph
before opening or closing the <div>, and open paragraph after. Also
changed newline placement to be the same as for other blocks.

The problem was that special blocks did not produce well-formed HTML
because they  wrapped the opening and closing
<div> tags in <p> tags.

TINYCHANGE

This patch only borrows a few lines from the handling of `CENTER'
blocks in org-export-as-html.

New option `org-table-formula-field-format'.

Format for fields which contain the result of a formula.
For example, using \"~%s~\" will display the result within tilde
characters.  Beware that modifying the display can prevent the
field from being used in another formula.

Based on an idea of Dov Grobgeld.

Merge branch 'master' of orgmode.org:org-mode

Make the function `org-program-exists' work on osx.

* org-clock.el (org-program-exists): Make the function
compatible with darwin systems.

Code indentation fix (tabify)

Avoid erroneous normalization of bracket link parts

* org-exp.el (org-export-normalize-links): Mark bracket links before
normalization to avoid erroneous normalization of bracket link parts.

This fixes a bug reported by M. Bauer at
<http://thread.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/49756> and allows proper
normalization of bracket links with a link in the query part, e.g.

[[http://example.tld?q=http://example.tld][Example]]

org.texi (Custom Table Styles - An Illustration): New node

Also improve various menus.

org.texi (Validating OpenDocument XML): New node

org-odt.el (org-export-odt-schema-dir): Modified

Makefile (PKG_FILES) : Include etc/

Also fix all byte-compiler warnings in org-lparse.el and org-odt.el.

Add string input variables to ob-octave.el. Add tests for ob-octave.el

org.texi: Improve ODT section

org.texi: Improve ODT section

org.texi: Improve ODT section

org.texi: Refine ODT section

doc/org.texi: Update ODT section

Add copyright and license info for files in etc/styles/

org-odt.el: Misc changes to reflect change in dir layout

* lisp/org-odt.el (org-odt-data-dir): Removed.
(org-odt-styles-dir, org-export-odt-schema-dir): New
variables.

Makefile (LISPF): Add org-lparse.el and org-odt.el

Also update dependencies.

org-exp.el: s/OpenDocumentText/OpenDocument Text/

org.el (org-modules): odt is no longer a contrib module

Move org-lparse.el and org-odt.el to the main lisp dir

Move contrib/odt/styles/*.xml to etc/styles

Delete org-export.el, org-mw.el and org-mm.el.

org-export.el conflicts with contrib/lisp/org-export.el and the
two org-mw.el org-mm.el don't work without it.  A rewrite of these
experimental exporters using Nicolas' org-export.el is necessary.

Revert "Rename EXPERIMENTAL/org-latex.el to EXPERIMENTAL/org-latex-old.el"

This reverts commit a75e29ca5bc14734c760823c28540730f7a6eff8.

UTILITIES/man*: Fix bug: don't insert </style>

Rename EXPERIMENTAL/org-latex.el to EXPERIMENTAL/org-latex-old.el

This is necessary to prepare release 7.8.

Merge branch 'master' of orgmode.org:org-mode

Add the binding for org-table-wrap-region to orgtbl-mode

EXPERIMENTAL/org-latex: Fix bug in table transcoding

* EXPERIMENTAL/org-latex.el (org-latex-table): Fix confusion between
  communication channel and table information plists.

contrib/lisp/org-export: Extract more properties from tables

* contrib/lisp/org-export.el (org-export-table-format-info): Extract
column width and and row groups.

Fix typos (already fixed in Emacs trunk.)

Thanks to Juanma Barranquero for spotting and fixing them in Emacs.

Fix bug in org-capture file+datetree+promt target type

* lisp/org-capture.el (org-capture-set-target-location): Set the capture
default time also to the prompt time.

In the file+datetree+promt target type, the user is being asked for a
date, where to file an entry.  In the template, there can the escape
placeholders for active and inactive time stamps.  So far, these were
filled with todays date.  This patch changes this behavior, so that
also at %t and %u escaped, the date entered at the prompt will be
used.

Reported by Erik Hetzner.

org-export: Cleanup #+name and #+results

* lisp/org-exp.el (org-export-res/src-name-cleanup): Remove #+name and
  #+results lines during preprocess.

Now Babel doesn't handle anymore those keywords cleanup (as #+name may
be used for other thing than code evaluation), that task is moved to
org-export.el.  See commit 25a0a0212193ecc5e910696301b3a64a51f837e0.

org.texi: Fix typos.

Thanks to Paul Eggert for spotting this and fixing it in Emacs.

contrib/lisp/org-element: Re-order a function within the file

contrib/lisp/org-element: Do not map function to ignored elements or objects

* contrib/lisp/org-element.el (org-element-map): In an export
  situation, only map function on included elements or objects.

contrib/lisp/org-export: Fix headline numbering

* contrib/lisp/org-export.el (org-export-persistent-properties-list):
  Remove unused persistent properties.
(org-export-initialize-persistent-properties): Delegate headline
  numbering alist to `org-export-collect-headline-numbering'.
(org-export-collect-headline-numbering): New function.
(org-export-update-info): Remove part relative to headline numbering.
(org-export-get-headline-number): Use new `:headline-numbering' to get
  current headline number.

Headline numbering is not done on demand anymore, but built once and
for all at the beginning of the export process, and stored in an
alist, accessible through the `:headline-numbering' property in the
communication channel.

EXPERIMENTAL/org-latex: Small refactoring.

* EXPERIMENTAL/org-latex.el (org-latex-footnote-reference): Small
  refactoring.

fix compiler warnings in ob-picolisp

* lisp/ob-picolisp.el (ob-comint): Required.
  (comint): Required.
  (cl): Required.
  (run-picolisp): Declared.
  (org-babel-execute:picolisp): Capture free variable, and replace
  function from cl-extra with core function.

moving ob-picolisp into the core

Thanks to Thorsten Jolitz for contributing support for this new
language.

* Makefile (LISPF): Add ob-picolisp to the Makefile.
* contrib/babel/langs/ob-picolisp.el: Remove from contrib.
* lisp/ob-picolisp.el: Add to core lisp directory.
* lisp/org.el (org-babel-load-languages): Add Pico Lisp to the list of
  supported code block languages.

improved warnings of bibtex errors during multi-headline export

* lisp/org-bibtex.el (org-bibtex): Now catches bibtex errors and
  directs the user to the location of the error.

EXPERIMENTAL/org-latex: LaTeX back-end for generic exporter

* EXPERIMENTAL/org-latex.el (org-latex-option-alist,
  org-latex-default-class, org-latex-classes
  org-latex-inputenc-alist, org-latex-date-format,
  org-latex-title-command, org-latex-format-headline-function, org-latex-emphasis-alist,
  org-latex-footnote-separator, org-latex-active-timestamp-format,
  org-latex-inactive-timestamp-format,
  org-latex-diary-timestamp-format, org-latex-image-default-option,
  org-latex-default-figure-position, org-latex-inline-image-extensions,
  org-latex-default-table-environment, org-latex-tables-centered,
  org-latex-tables-verbatim, org-latex-table-caption-above,
  org-latex-format-drawer-function,
  org-latex-format-inlinetask-function, org-latex-listings, org-latex-listings-langs,
  org-latex-listings-options, org-latex-minted-langs,
  org-latex-minted-options, org-latex-quotes,
  org-latex-custom-lang-environments): New variables.
(org-latex--caption/label-string, org-latex--guess-inputenc,
  org-latex--find-verb-separator, org-latex--make-option-string,
  org-latex--quotation-marks, org-latex--wrap-label,
  org-latex-template, org-latex-center-block, org-latex-drawer,
  org-latex-dynamic-block, org-latex-emphasis, org-latex-entity,
  org-latex-example-block, org-latex-export-snippet,
  org-latex-export-block, org-latex-fixed-width,
  org-latex-footnote-reference, org-latex-headline,
  org-latex-horizontal-rule, org-latex-inline-src-block,
  org-latex-inlinetask, org-latex-item, org-latex-keyword,
  org-latex-latex-environment, org-latex-latex-fragment,
  org-latex-line-break, org-latex-link--inline-image, org-latex-link,
  org-latex-macro, org-latex-paragraph, org-latex-plain-list,
  org-latex-plain-text, org-latex-property-drawer,
  org-latex-quote-block, org-latex-quote-section,
  org-latex-radio-target, org-latex-special-block,
  org-latex-src-block, org-latex-statistics-cookie,
  org-latex-subscript, org-latex-superscript,
  org-latex-table--format-string, org-latex-table--align-string,
  org-latex-table, org-latex-target, org-latex-time-stamp,
  org-latex-verbatim, org-latex-verse-block): New functions.

contrib/lisp/org-export: Fix visibility influence on list parsing

* contrib/lisp/org-export.el (org-export-with-current-buffer-copy):
  Full invisibility prevents `current-column' from returning useful
  values.  Thus, keep visibility related text-properties and set
  `buffer-invisibility-spec' to nil.

note that colnames behavior may differ across languages

* doc/org.texi (colnames): Note that colnames behavior may differ
  across languages.

tests for the colnames header argument

org-agenda.el (org-agenda-dim-blocked-tasks): Fix typo.

* org-agenda.el (org-agenda-dim-blocked-tasks): Fix typo.

Thanks to Paul Eggert for spotting this and fixing it in Emacs trunk.

org.texi (Weekly/daily agenda, Agenda commands): Fix typos.

* org.texi (Weekly/daily agenda, Agenda commands): Fix typos.

Thanks to Paul Eggert for spotting this.

Fix typo fixed in Emacs trunk.

* ob.el (org-babel-execute-src-block): Fix typo.

Thanks to Juanma Barranquero for spotting this.

Fix typos fixed in Emacs trunk.

* org-freemind.el (org-freemind-write-mm-buffer): Fix typo.

* org-colview.el (org-columns-edit-value) (org-columns-next-allowed-value):
  Fix typos.

* org-bibtex.el (org-bibtex-autogen-keys): Fix typo.

* org-clock.el (org-clock-special-range): Fix typo.

Thanks to Paul Eggert for these fixes.

org.el: Fix two typos in docstrings.

* org.el (org-link-unescape, org-link-unescape-compound): Fix two
  typos in docstrings.