Release 7.8.04

Merge branch 'maint'

doc/org.texi: Use "ODT" instead of @acronym{ODT}.

Using @acronym{} is better but we need to make this
change on the whole document and check that the doc
compiles correctly on the server with it.

Merge branch 'maint'

org-habit.el: Fix bug while inserting habit graph in the agenda buffer.

* org-habit.el (org-habit-insert-consistency-graphs): Fix bug
while inserting habit graph in the agenda buffer.

TINYCHANGE

Correctly match source block edit buffers.

* org-src.el (org-src-edit-buffer-p): New function.

* org.el (org-store-link): Use the new function to correctly
match source code buffer.

TINYCHANGE

Thanks to Ilya Shlyakhter for this patch.

Merge branch 'maint'

org-agenda.el: Fix the order conditions are being checked.

* org-agenda.el (org-agenda-skip-if): Fix the order conditions
are being checked.  Also enhance the docstring a bit.

TINYCHANGE

Thanks to Toby Cubitt for a patch to this effect.

org-agenda.el: Fix the display of indirect agenda window.

* org-agenda.el (org-agenda-tree-to-indirect-buffer): Fix the
display of indirect agenda window.

TINYCHANGE

Thanks to Dave Abrahams for a patch to this effect.

org.el: Fix XEmacs compatibility bug when creating images.

* org.el (org-create-formula-image, org-dvipng-color): Fix
XEmacs compatibility bug.

TINYCHANGE

Thanks to Uwe Brauer for this patch.

Clocking work time: faster filtering of clock entries by trusting org-scanner-tags

* lisp/org-clock.el (org-clock-get-table-data): Bind org-scanner-tags
to tags-list and org-trust-scanner-tags to t while evaluating the
matcher, since the matcher is always evaluated at the current entry.

TINYCHANGE

Merge branch 'master' of orgmode.org:org-mode

tags search: faster tags matcher by trusting scanner tags

On 3/16/2012 2:10 AM, Nick Dokos wrote:
 > One more thing that you'll need to do is put your patches in attachments
 > of a type that will allow patchwork to snag the patch:

Thanks, I was wondering why they're not showing up.
Here is another try (attached) for the org.el patch.

ilya
>From 95c38b06803aec0787bc2eaab3d0062221390292 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Ilya Shlyakhter <ilya_shl@alum.mit.edu>
Date: Fri, 16 Mar 2012 00:10:25 -0400
Subject: [PATCH 2/2] Tags/properties matcher: faster matching by trusting
 org-scanner-tags

* lisp/org.el (org-scan-tags): Bind org-trust-scanner-tags to t
while evaluating the matcher, since the matcher is always evaluated
at the current entry.

TINYCHANGE

Fixed compiler warnings, including one small bug in ob-lilypond

* lisp/ob-lilypond.el (ly-compile-lilyfile): Fixed misplaced comma in a
quoting expression.

* lisp/org-pcomplete.el: added missing defvar definitions for org vars

* lisp/org-src.el: added declare-function line for org-babel-tangle

* lisp/ob.el (org-scan-tags): protected the variable tags-list with a let
(other) added missing defvar declarations.

TINYCHANGE

documentation of this new option to the :noweb header argument

* doc/org.texi (noweb): Documentation of this new option to the :noweb
  header argument.

add "eval" option to noweb

* lisp/ob.el (org-babel-merge-params): Add "eval" as acceptable noweb
  argument.
  (org-babel-noweb-p): The "eval" argument only expands during
  evaluation.

org-e-odt: Use new source code handling API

org-element: Unhide contents of collapsed elements before entering them

* contrib/lisp/org-element.el (org-element-down): Unhide contents of
  collapsed elements before entering them.

Merge branch 'origin-maint'

Conflicts:
lisp/org-src.el

fix compiler warnings

* lisp/ob.el (org-strip-protective-commas): Declared.
* lisp/org-agenda.el (org-agenda-filtered-by-category): Declared.
  (org-agenda-filter-apply): Capture free variable.
* lisp/org-footnote.el (org-skip-whitespace): Declared.
* lisp/org-mobile.el (org-agenda-filter): Declared.
* lisp/org-src.el (org-strip-protective-commas): Declared.

Merge branch 'origin-maint'

Add autoload instruction before org-version

* org.el (org-version): Add autoload cookie.

TINYCHANGE

org-e-html: Use new source code handling API

Merge branch 'maint'

Remove spurious quote in customization form choice

* org-attach.el (org-attach-store-link-p): Remove spurious quote in
customization form choice.

Glitch discovered and fix suggested by Henning Weiss in
<CAKq33udFSsBP0egVrgfjcBnou+PhKtyYaGBn0SfMicp42h0=kw@mail.gmail.com>>.

Merge branch 'maint'

Add missing word to org-contacts y-or-n-p question

* org-contacts.el (org-contacts-check-mail-address): Add missing word
to y-or-n-p question.

apply :shebang and :padline to shell script execution

* lisp/ob-sh.el (org-babel-execute:sh): Pass all params to subroutine.
  (org-babel-sh-evaluate): Apply :shebang and :padline to shell script
  execution.

Merge branch 'origin-maint'

Ensure correct order for empty result wrapping blocks.

* lisp/ob.el (org-babel-insert-result): Ensure correct order for empty
  result wrapping blocks.

fix whitespace errors

Make auditioning of midi and pdf generations asynchronous, and add easy pdf generation.

* lisp/ob-lilypond.el: Make auditioning of midi and pdf asynchronous,
  and add easy pdf generation in the form of `ly-gen-pdf' variable.

* testing/lisp/test-ob-lilypond.el: Tests for above.

org-export: Remove useless INFO argument from `org-export-unravel-code'

* contrib/lisp/org-export.el (org-export-unravel-code): Remove INFO
  argument.  Fix a bug preventing code references to be properly
  recognized.
(org-export-format-code-default): Apply signature change.
(org-export-resolve-coderef): Fix a bug preventing code references to
be properly recognized.
* EXPERIMENTAL/org-e-latex.el (org-e-latex-src-block): Apply signature
  change.
* testing/lisp/test-org-export.el: Add tests.

test-org-element: Fix a test about block switches

org-export: Change source code handling API

* contrib/lisp/org-element.el (org-element-example-block-parser,
  org-element-src-block-parser): Add `:number-lines',
  `:preserve-indent, `:retain-labels', `:use-labels'  and
  `:label-fmt' properties.
* contrib/lisp/org-export.el (org-export-resolve-coderef,
  org-export-get-loc): Apply changes to src-block and example-block
  elements' properties.
(org-export-unravel-code, org-export-format-code,
org-export-format-code-default): New functions.
(org-export-handle-code): Removed function.
* EXPERIMENTAL/org-e-latex.el (org-e-latex-example-block): Use new
  function.
(org-e-latex-src-block): Use new API.  Better handling of numbered
lines with special packages.
* EXPERIMENTAL/org-e-ascii.el (org-e-ascii-example-block,
  org-e-ascii-src-block): Use new functions.
* testing/lisp/test-org-element.el: Add tests.
* testing/lisp/test-org-export.el: Add tests.

org-element: New `org-element-down' function

* contrib/lisp/org-element.el (org-element-down): New function.
* testing/lisp/test-org-element.el: Add test.

Merge branch 'origin-maint'

The link generated by org-store-link is escaped twice when tangling with ":comments yes" flag.

* ob-tangle.el (org-babel-spec-to-string): The link generated by
  org-store-link is escaped twice when tangling with ":comments yes"
  flag.

org-html.el (org-export-as-html): Remove another useless space before tag.

* org-html.el (org-export-as-html): Remove another useless
space before tag.

Thanks to Mathias Bauer for spotting this.

org-html.el (org-export-as-html): Remove another useless space before tag.

* org-html.el (org-export-as-html): Remove another useless
space before tag.

Thanks to Mathias Bauer for spotting this.

Merge branch 'maint'

org-html.el (org-export-as-html): Remove useless space before tag.

* org-html.el (org-export-as-html): Remove useless space
before tag.

Thanks to Mathias Bauer for spotting this.

Add autoload instruction before org-version

* org.el (org-version): Add autoload cookie.

TINYCHANGE

Merge branch 'maint'

org.el (org-get-category): Save match data.

* org.el (org-get-category): Save match data.

Thanks to Adam Spiers for spotting this issue.

Merge branch 'maint'

Fix typos

Add example demonstrating LaTeX_CLASS_OPTIONS

* org.texi (Header and sectioning): Add example demonstrating how to use
  "LaTeX_CLASS_OPTIONS".

TINY CHANGE

Merge branch 'master' of orgmode.org:org-mode

org-e-html: Improve handling of images, headlines and inlinetasks

1. Handle inlining of remote images
2. Proper handling of "alt" attribute for regular imgages and dvipnged
   fragments.
3. Support for Inlinetasks
4. Headlines are "transcoded" in three places:
   - org-e-html-headline (`org-e-html-format-headline')
   - org-e-html-inlinetask
   - org-e-html-toc (`org-e-html-format-toc-headline')

   These are now conveniently wrapped and cleared through
   'org-e-html-format-headline--wrap'.  The regular and toc headlines
   formatters mentioned afore take a superset of arguments allowed by
   `org-e-html-format-headline-function'.  Augmenting the signature of
   the `org-e-html-format-headline-function' is worth considering.

Merge branch 'master' of orgmode.org:org-mode

org-export: Small fix

* contrib/lisp/org-export.el (org-export-get-ordinal): Change signature.
* EXPERIMENTAL/org-e-ascii.el (org-e-ascii--build-caption): Apply
  changes to previous function

org-export: Predicate in `org-export-get-ordinal' accepts two arguments

* contrib/lisp/org-export.el (org-export-get-ordinal): Predicate in
  `org-export-get-ordinal' accepts two arguments.

Merge branch 'master' of orgmode.org:org-mode

org-e-html: Support for enumerating inline images

Merge branch 'master' of orgmode.org:org-mode

Merge branch 'origin-maint'

describe the ability to execute noweb references in the manual

* doc/org.texi (Noweb reference syntax): Describe the ability to
  execute noweb references in the manual.

Merge branches 'maint' and 'master' of orgmode.org:org-mode

Merge branch 'maint' of orgmode.org:org-mode

Merge branch 'origin-maint'

improved sbe documentation

Merge branch 'origin-maint'

fix two bugs related to calling tangle with a prefix argument

* lisp/ob-tangle.el (org-babel-tangle): Don't prompt for a file name
  if :tangle is specified.
* lisp/ob.el (org-babel-expand-noweb-references): Widen buffer when
  expanding noweb references.

Merge branch 'origin-maint'

fixed bug in `sbe' when variables are force interpreted as strings

* lisp/ob-table.el (sbe): Don't accidentally leave a `t' value when
  variables are force interpreted as strings.

Merge branch 'master' of orgmode.org:org-mode

Merge branch 'maint'

org-bbdb in master already contained declare-function for external
bbdb-functions.

Conflicts:
lisp/org-bbdb.el

org-e-odt: Bring it to the same level as org-e-html

org-bbdb: Pass variable to avoid dynamic scoping.

* org-bbdb.el (org-bbdb-open, org-bbdb-open-old)
(org-bbdb-open-new): Pass record name to avoid dynamic scoping.

org-bbdb: Declare functions, silence byte compiler

* org-bbdb.el (bbdb-record-get-field, bbdb-search-name)
(bbdb-search-organization): Declare functions to silence byte
compiler.

Fix task cloning for repeating tasks

* org.el (org-clone-subtree-with-time-shift): Fix task cloning for
repeating tasks using .+n and ++n syntax

Tasks with repeaters using .+n and ++n syntax retain the repeater in
all of the clones causing duplicate tasks.  These tasks are now
handled the same as the regular repeating task using +n syntax.

org-agenda: Handle case of heading w/ date but no keyword

* lisp/org-agenda.el (org-agenda-highlight-todo): Handle the case of a
  heading that has a date but no todo keyword.

This is a fix for the args-out-of-range bug discussed in these threads:

  http://thread.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/52621
  http://thread.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/52793
  http://thread.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/52786
  http://thread.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/52810

The discussions involved Ilya Shlyakhter, James Atwood, Nick Dokos,
and myself, and the subject headers are:

  bug report: agenda timeline crashes
  Bug report: weekly agenda and blank, timestamped headers
  org-agenda-list (from git) giving "args-out-of-range error"

TINYCHANGE

org-e-html: Support for cross references

Merge branch 'maint'

test-org-footnote: Fix a broken test (part 2)

* testing/lisp/test-org-footnote.el: Fix
  `test-org-footnote/normalize-outside-org'.

Merge branch 'maint'

test-org-footnote: Fix a broken test

* testing/lisp/test-org-footnote.el: Fix failing
  `test-org-footnote/normalize-outside-org'.

test-org-export: Fix broken test

* testing/lisp/test-org-export.el (test-org-export/export-scope): In
  batch mode, `transient-mark-mode' must be turned on.

org-export: Avoid duplicates in `org-export-collect-footnote-definitions'

* contrib/lisp/org-element.el (org-element-map): New optional argument
  to avoid recursion into certain recursive types.
* contrib/lisp/org-export.el (org-export-footnote-first-reference-p,
  org-export-get-footnote-number,
  org-export-collect-footnote-definitions): Use new argument from
  `org-element-map'.
* testing/lisp/test-org-export.el: Add test.

The new argument allows to force entering footnotes definitions at
a certain time (when their first reference is found) but not a second
time when they are encountered in the parse tree.

Thanks to Jambunathan for reporting this.

adding a test to protect the "results don't replace code block" functionality

fix code block replacement with results

* lisp/ob.el (org-babel-find-named-result): Fix code block replacement
  with results.

fix code block replacement with results

* lisp/ob.el (org-babel-find-named-result): Fix code block replacement
  with results.

Merge branch 'maint'

org-footnote: Small fix to previous commit

* lisp/org-footnote.el (org-footnote-normalize): Do not normalize
  labels when sort-only is non-nil.

Merge branch 'maint'

org-footnote: Clean-up `org-footnote-normalize'

* lisp/org-footnote.el (org-footnote-normalize): Remove an useless
  part of the function.
(org-insert-footnote-reference-near-definition): Remove function.

Merge branch 'maint'

org-footnote: Fix normalization of inline footnotes with no footnote section

* lisp/org-footnote.el (org-footnote-normalize): Fix normalization of
  inline footnotes with no footnote section.
* testing/lisp/test-org-footnote.el: New test file.

Thanks to Samuel Wales for reporting this.

Merge branch 'origin-maint'

improve cache documentation when session evaluation is used

* doc/org.texi (cache): Improve cache documentation when session
  evaluation is used.

Merge branch 'maint'

org-bbdb: Check for BBDB version depending on available functions

* org-bbdb.el (org-bbdb-old): Replace `defvar' after loading 'bbdb to
check for old or new version by a check for the required function in
`org-bbdb-open' and `org-bbdb-store-link'.
(org-bbdb-store-link, org-bbdb-open): Check which version of bbdb is
to be used.

This is a follow up of ddf4f1e7a95608b2223dee7170ecd4a51788def4.

Instead of depending on the loading of bbdb we do a check for the
required function in `org-bbdb-open' and `org-bbdb-store-link'.

org-e-html: Fix a typo

test-org: Fix a broken test

* testing/lisp/test-org.el (test-org-export/fuzzy-links): Fix the "No
  link found" error.

org-e-html/org-e-odt: Support for code numbering

Merge branch 'origin-maint'

Don't miss a code block when there are confounding spaces after the result name.

* lisp/ob.el (org-babel-find-named-result): Don't miss a code block
  when there are confounding spaces after the result name.

Merge branch 'origin-maint'

Fixed call line matching regular expressions

* lisp/ob-lob.el (org-babel-block-lob-one-liner-regexp): Less greedy
  regular expressions.
  (org-babel-inline-lob-one-liner-regexp): Less greedy regular
  expressions.