org.el (org-tsr-regexp-both): Don't activate dates in links

* org.el (org-tsr-regexp-both): Don't activate dates in links.
(org-activate-dates): Change match boundaries according to the
new value of `org-tsr-regexp-both'.

Thanks to Richard Huang for reporting a related issue.

org-agenda.el (org-agenda-to-appt): Fix typos

* org-agenda.el (org-agenda-to-appt): Fix typos.

Thanks to Sean Allred for reporting this.

org-agenda.el (org-agenda-local-vars): Don't include `org-agenda-show-window'

* org-agenda.el (org-agenda-local-vars): Don't include
`org-agenda-show-window' as it needs to be checked outside of
the agenda window.

Thanks to Bernt Hansen for reporting this.

org.el (org-set-tags-command): Fix bug.

* org.el (org-set-tags-command): Fix bug when setting tags for
multiple headlines in an active region.

Do not set the end of the region back to the beginning of the
previous headline.

fix wrong key for org-reload uncompiled in menu

* lisp/org.el (org-org-menu): Use correct key "C-u C-c C-x !" to do
  org-reload uncompiled in the menu.

The key binding has been changed in 8619361669 due to a conflict with
agenda mode, but the menu entry had never been corrected.

Enhance doc wrt interactions between `org-startup-folded' and `org-agenda-inhibit-startup'

* org.el (org-startup-folded):
* org.texi (Visibility cycling): Suggest to set
`org-agenda-inhibit-startup' to nil if user wants the startup
visibility settings to be honored in any circumstances.

Thanks to Tassilo for pointing this.

Fix `org-insert-heading-respect-content'

* org-mobile.el (org-mobile-edit): DTRT when inserting a heading
in an invisible region.

* org.el (org-insert-heading-respect-content): New
`invisible-ok' parameter.  Add docstring.
(org-insert-todo-heading-respect-content): Add docstring.

Thanks to James Harkins for the extra detailed reports and
the proposed solutions, both for org.el and org-mobile.el.

ob-tangle.el (org-babel-tangle-collect-blocks): Bugfix: remove code references from blocks

* ob-tangle.el (org-babel-tangle-collect-blocks): Bugfix:
remove code references from blocks.

Thanks a lot to Michael Alan Dorman for reporting this.

Backport typo fixes from Emacs revno 111250 by Paul Eggert.

Revert "org-exp.el (org-export-normalize-links): Don't match links within tags"

This reverts commit 80cb1b0a09f53ae9a6dd37c7884ec6a26e29e12c.

org-agenda.el: Fix bug when displaying a temporary overlay

* org-agenda.el (org-agenda-schedule, org-agenda-deadline):
Cosmetic changes.
(org-agenda-show-new-time): Fix bug when displaying a
temporary overlay with the scheduled/deadline information.

Thanks to Thomas Morgan for reporting this bug and testing the patch.

org.el (org-fill-paragraph-with-timestamp-nobreak-p): New function

* org.el (org-fill-paragraph-with-timestamp-nobreak-p): New
function.
(org-setup-filling): Use it to prevent breaking a timestamp
when filling a paragraph.

Thanks to William for requesting this.

org.texi (Progress logging, Checkboxes): Fix typos

* org.texi (Progress logging, Checkboxes): Fix typos.

Thanks to Gregory Benjamin for this.

Fix typos in orgguide.texi.

Remove additions from contrib/ before moving HEAD

* mk/targets.mk (up0): Explicitly remove additions from contrib/
  before moving HEAD via git since the files might be renamed, deleted
  or moved by checking out a new version.

Thanks to Suvayu Ali for pointing to this problem.  The user still has
to remember to do this when moving HEAD manually, though.

org-id.el (org-id-get-with-outline-path-completion): Fix docstring

* org-id.el (org-id-get-with-outline-path-completion): Fix
docstring.

Thanks to Florian Beck for reporting this.

org-agenda.el: Bugfix.

* org-agenda.el (org-agenda-get-deadlines)
(org-agenda-get-scheduled): Fix bug: use text properties for
the headline text since we rely on properties to get e.g. the
effort.

org.el (org-get-wdays): Handle matching a lead time specified in hours

* org.el (org-get-wdays): Handle matching a lead time specified in
hours.

TINYCHANGE

A lead time in hours is matched but will erroneously return nil.

org-exp.el (org-export-normalize-links): Don't match links within tags

* org-exp.el (org-export-normalize-links): Don't match links
within tags.

A headline with tags like :info:test: would not be exported correctly
because info:test is first matched and normalized as a link.

org-element: Fix macro parsing with protected commas

* lisp/org-element.el (org-element-macro-parser): Fix error when last
  argument ends with a protected comma.
* testing/lisp/test-org-element.el (test-org-element/macro-parser):
  Add tests.

org-clock.el (org-clock-sum): Fix indentation

org-clock.el (org-clock-sum): Protect with `org-unmodified'

* org-clock.el (org-clock-sum): Protect with `org-unmodified'.

TINYCHANGE

org-html.el: Enhance docstrings

* org-html.el (org-export-html-preamble-format)
(org-export-html-postamble-format): Mention that
org-export-html-preamble/postamble need to be `t' in order for
these variables to have any effect.

org-html.el (org-html-handle-links): Fix bug in setting the attribute for link with images

* org-html.el (org-html-handle-links): When the link
description is an image and the attribute is "width",
pass the attribute to the <img ...> tag.

Thanks to John Hendy for reporting this.

org-macs.el (org-unmodified): Inhibit modification hooks

* org-macs.el (org-unmodified): Inhibit modification hooks.

TINYCHANGE

org.texi (References): Clarify an example

* org.texi (References): Clarify an example.

Thanks to Xue Fuqiao, Eric S Fraga and H. Dieter Wilhelm
for sorting this out.

org-bibtex.el (org-bibtex-search): Don't throw an error when `org-bibtex-prefix' is nil

* org-bibtex.el (org-bibtex-search): Don't throw an error when
`org-bibtex-prefix' is nil.

TINYCHANGE

org.el: Always honor `org-startup-indented', even when `org-inhibit-startup' is non-nil

* org.el (org-mode): Always honor `org-startup-indented', even
when `org-inhibit-startup' is non-nil.

* org-indent.el (org-indent-mode): Don't check
`org-inhibit-startup'.

Thanks to Carsten for suggesting this.

org-e-odt.el (org-e-odt--export-wrap): Use `condition-case'

* org-e-odt.el (org-e-odt--export-wrap): Use `condition-case'.

org.el (org-fontify-meta-lines-and-blocks-1): Don't try to add text properties outside of the buffer

* org.el (org-fontify-meta-lines-and-blocks-1): Don't try to
add text properties outside of the buffer.

Thanks to Leo Liu for reporting this.

org.el (org-agenda-inhibit-startup): Rename from `org-agenda-inhibit-startup-visibility-cycling'

* org.el (org-agenda-inhibit-startup): Rename from
`org-agenda-inhibit-startup-visibility-cycling'.
(org-agenda-prepare-buffers): Bind `org-inhibit-startup' to
`org-agenda-inhibit-startup'.

org.el (org-mode): Don't initialize `org-beamer-mode' when `org-inhibit-startup' is non-nil

* org.el (org-mode): Don't initialize `org-beamer-mode' when
`org-inhibit-startup' is non-nil.

org-footnote.el: Fix bug when using `electric-indent-mode'

* org-footnote.el (org-footnote-create-definition): Prevent
`electric-indent-mode' from inserting the definition at the
wrong place.

Thanks to Xue Fuqiao for reporting this bug.

org-agenda.el: Delete `org-agenda-no-heading-message'

* org-agenda.el (org-agenda-no-heading-message): Delete.
(org-agenda-get-timestamps, org-agenda-get-progress)
(org-agenda-get-deadlines, org-agenda-get-scheduled)
(org-agenda-get-blocks): Don't use
`org-agenda-no-heading-message', skip the entry.

org.el (org-agenda-inhibit-startup-visibility-cycling): New option

* org.el (org-agenda-inhibit-startup-visibility-cycling): New
option.
(org-agenda-prepare-buffers): Use it to speed up the agenda
generation.

This change will boost agenda creation *a lot*, especially for
people using many agenda files.  See the docstring of the new
option for details.

org-agenda.el (org-agenda-skip): Fix bug by correctly skipping commented scheduled/deadline lines

* org-agenda.el (org-agenda-skip): Fix bug by correctly
skipping commented scheduled/deadline lines.

This fixes a bug introduced in
http://orgmode.org/cgit.cgi/org-mode.git/commit/?id=211b13

Fix compiler warning.

org.texi (Installation): Enhance instructions again

* org.texi (Installation): Enhance instructions again.

org.texi (Org-Plot): Update link

* org.texi (Org-Plot): Update link.

Thanks to Xue Fuqiao for reporting this.

org-clock.el (org-clock-in): Fix bug when fetching the effort value

* org-clock.el (org-clock-in): Fix bug when fetching the effort
value.

Thanks to Vasil S. Diadov for reporting this bug and proposing a patch.

ob-python.el: Fix compatibility bug.

* ob-python.el (org-babel-python-command): Fix docstring.
(org-babel-python-initiate-session-by-key): Fix bug: `run-python'
from Emacs >24.1 requires a python command as an argument.

Thanks to Myles English for raising this issue.

org-element.el (org-element-at-point): Fix typo in docstring

* org-element.el (org-element-at-point): Fix typo in docstring.

org-agenda.el (org-agenda-get-deadlines): Fix bug: use `org-agenda-show-inherited-tags'

* org-agenda.el (org-agenda-get-deadlines): Fix bug: use
`org-agenda-show-inherited-tags'.

Thanks to Kiwon Um for reporting this.

org-agenda.el (org-agenda-skip): Correctly handle commented out scheduled/deadline lines

* org-agenda.el (org-agenda-skip): Correctly handle commented
out scheduled/deadline lines.  Refactor.

Thanks to Rainer Stengele for reporting this and to Nick Dokos for
investigating further.  This fix will not slow down the agenda as checking
for a text property seems equally fast (and perhaps even slightly faster)
than checking the character after.

org.texi (Checkboxes, Radio lists): Fix typos

* org.texi (Checkboxes, Radio lists): Fix typos.

Small typo correction

TINYCHANGE

org-agenda.el (org-agenda-quit): Delete indirect buffer's window only when it exists

* org-agenda.el (org-agenda-quit): Delete indirect buffer's window
only when it exists.

When indirect buffer's window doesn't exist, the original logic will
delete the current window.

TINYCHANGE

org-install.el: Do not warn users.

* org-install.el: Do not warn users.

org.el (org-adaptive-fill-function): Fix various bugs when filling in message-mode

* org.el (org-adaptive-fill-function): In message-mode, don't
lines in the message header, nor table lines in the body.
Correctly fill lines starting with `org-outline-regexp' in the
body.

org-element: Improve some docstrings

* lisp/org-element.el (org-element-parse-buffer, org-element-map,
  org-element-at-point, org-element-context): Be more verbose in
  docstrings.  Also fix typos.

org-list: Fix bug when repairing checkbox with an ORDERED property

* lisp/org-list.el (org-list-struct-fix-box): When a checkbox has to
  be resetted because of a non-nil ORDERED property value, make sure
  it had a checkbox already.

org-agenda.el (org-agenda-open-link): Fix bug with opening all links

* org-agenda.el (org-agenda-open-link): Fix bug with opening
all links.

Thanks to Ingo Lohmar for pointing this.

org-agenda.el (org-search-view): Fix checking `org-agenda-show-inherited-tags'

* org-agenda.el (org-search-view): Fix checking
`org-agenda-show-inherited-tags'.

TINYCHANGE

Delete `org-condition-case-unless-debug'

* org-compat.el (org-condition-case-unless-debug): Delete.

* org-odt.el (org-odt-cleanup-xml-buffers): Use
`condition-case' instead of `org-condition-case-unless-debug',
which is now deleted.

Revert "Backwards compatibility: don't defalias special forms"

This reverts commit b63275350f524df5e33c2aa915de4415f312f409.

Revert "Compatibility: Use org-define-obsolete-{function,variable}-alias"

This reverts commit 305f29776fba57cdd1566071e0e8a75270d095c6.

* org-mobile.el (org-mobile-write-agenda-for-mobile): Fix bug
when replacing the heading.

Thanks to Jeff Myer for reporting this.

org-depend.el (org-depend-trigger-todo): Fix bug

* org-depend.el (org-depend-trigger-todo): Fix bug: use
`org-refresh-properties'.  Also fix some compiler warnings.

Thanks to Karl Voit for reporting this.

Docstring fixes.

* org-capture.el (org-capture-templates-contexts):
* org-agenda.el (org-agenda-custom-commands-contexts):
Docstring fix.

Restore previous behavior for inherited tags, now just more flexible

* org.el (org-get-tags-at): Remove duplicate inherited tags.

* org-agenda.el (org-agenda-show-inherited-tags): Allow to be
set to 'always or to a list of agenda types.
(org-agenda-finalize): Rework conditions under which inherited
tags should be made available even when not displayed.
(org-search-view, org-agenda-get-todos)
(org-agenda-get-timestamps, org-agenda-get-sexps)
(org-agenda-get-progress, org-agenda-get-scheduled)
(org-agenda-get-blocks): Use new possible values of
`org-agenda-show-inherited-tags'.

Thanks to Karl Voit and Tassilo Horn who first reported this.

org.texi (Installation): Simplify

* org.texi (Installation): Simplify.

org.el (org-open-at-point): Fix opening all links at point

* org.el (org-open-at-point): Fix opening all links at point.

Thanks to Ingo Lohmar for reporting this.

org-agenda.el (org-get-entries-from-diary): Turn off `diary-file-name-prefix'

* org-agenda.el (org-get-entries-from-diary): Turn off
`diary-file-name-prefix' instead of
`diary-file-name-prefix-function', the former is checked
before the latter.

Thanks to Andreas Merziger for reporting this as Emacs bug#13396.

ob-eval.el (org-babel-shell-command-on-region): Use `executable-find' for local `shell-file-name'

* ob-eval.el (org-babel-shell-command-on-region): Use
`executable-find' for local `shell-file-name'.

org.texi: Update documentation on internal link handling

* org.texi (Handling links): Update the mention to the
obsolete variable `org-link-to-org-use-id' with a mention to
the newer variable `org-id-link-to-org-use-id'.  Mention the
need to load the org-id library.

TINYCHANGE

org.el (org-edit-special): Check for table.el before checking for Org tables

* org.el (org-edit-special): Check for table.el before
checking for Org tables.

Thanks to Jacobo de Vera for reporting this.

doc/org.texi: Update copyright year.

org-agenda.el (org-agenda-finalize): Inhibit readonly for the whole function

* org-agenda.el (org-agenda-finalize): Inhibit readonly for
the whole function.

Thanks to J. David Boyd for hitting this bug and reporting it.

org-src.el (org-edit-src-find-region-and-lang): Try to find table.el tables first

* org-src.el (org-edit-src-find-region-and-lang): Try to find
table.el tables first.

Thanks to Jacobo de Vera for insisting on this.

org-jsinfo.el (org-infojs-template): Fix copyright years

* org-jsinfo.el (org-infojs-template): Fix copyright years.

org.texi: Document `org-mark-element' and `org-mark-subtree'

* org.texi (Structure editing): Document `org-mark-element'
and `org-mark-subtree'.
(Tag inheritance): Document `org-agenda-use-tag-inheritance'.

Thanks to Nathaniel Cunningham for requesting this.

org-src.el (org-edit-src-code): Fix bug when trying to edit a table.el table

* org-src.el (org-edit-src-code): Fix bug when trying to edit
a table.el table.

Thanks to Jacobo de Vera for reporting this regression.

Various small fixes

Update Copyright lines to match Emacs format.

org-agenda (org-agenda-finalize): Don't remove tag alignment

* org-agenda.el (org-agenda-finalize): Don't remove tag
alignment depending on `org-prefix-has-tag', this should
depend on `org-agenda-remove-tags'.

Thanks to Rainer Stengele for reporting this.

doc/orgguide.texi: Update menu

etc/ORG-NEWS: Update

org-agenda.el (org-agenda-finalize): Downcase tags when readding them after agenda generation

* org-agenda.el (org-agenda-finalize): Downcase tags when
readding them after agenda generation.

Ignore `auto-fill-inhibit-regexp'

* lisp/org.el (org-setup-filling): Ignore `auto-fill-inhibit-regexp'.
  The idea behind this is that `org-adaptive-fill-function' already
  determines which lines should be filled.

org.el (org-setup-filling): Set `auto-fill-inhibit-regexp' from `org-outline-regexp'

* org.el (org-setup-filling): Set `auto-fill-inhibit-regexp'
from `org-outline-regexp'.

Thanks to John Hendy for reporting a problem in this area.

org-icalendar.el (org-icalendar-ts-to-string): Fix bug in converting timezone

org-icalendar.el (org-icalendar-ts-to-string): Fix bug in converting
timezone.

TINYCHANGE

etc/ORG-NEWS: Add information about Org 7.9.3

org-agenda.el (org-agenda-use-tag-inheritance): Fix custom definition

* org-agenda.el (org-agenda-use-tag-inheritance): Fix custom
definition.

org.texi (Pushing to MobileOrg): Fix footnote about the use of symbolic links in `org-directory'

* org.texi (Pushing to MobileOrg): Fix footnote about the use
of symbolic links in `org-directory'.

org.el (org-entry-get): Speed up by let-binding some variables only if needed

* org.el (org-entry-get): Speed up by let-binding some
variables only if needed.  Also fix a bug: consider an empty
drawer as no drawer.

Thanks to William Léchelle for reporting this.

org-agenda.el: New option `org-agenda-use-tag-inheritance'

* org-agenda.el (org-search-view, org-agenda-get-todos)
(org-agenda-get-timestamps, org-agenda-get-sexps)
(org-agenda-get-progress, org-agenda-get-deadlines)
(org-agenda-get-scheduled, org-agenda-get-blocks)
(org-agenda-change-all-lines): Get local tags only.
(org-agenda-use-tag-inheritance): New option.
(org-agenda-finalize): When `org-agenda-use-tag-inheritance'
is non-nil, possibly reset tags in the agenda buffer.
(org-agenda-check-type): Enhance docstring.

See the docstring of the new option for details.

org.el (org-use-tag-inheritance): Fix typo in docstring

* org.el (org-use-tag-inheritance): Fix typo in docstring.

`org-float' is now obsolete

* org-agenda.el (org-float): Don't alias `org-float'.

* org.texi (Timestamps, Deadlines and scheduling): Use
`diary-float' instead of the now obsolete alias `org-float'.

* test-org-element.el
(test-org-element/timestamp-interpreter): Ditto.

org.el (org-scan-tags): The skipper already checks for archived entries

* org.el (org-scan-tags): The skipper already checks for
archived entries.

org-clock.el: Fix last commit.

Speed up setting/getting the APPT_WARNTIME property.

* org.el (org-refresh-properties): Rename from
`org-refresh-effort-properties' and use two new parameters.
(org-agenda-prepare-buffers): Use `org-refresh-properties'.
Also refresh the 'org-appt-warntime text property.

* org-clock.el (org-clock-in): Use the renamed defun.

* org-icalendar.el (org-icalendar-print-entries): Refresh the
'org-appt-warntime property.
(org-icalendar-print-entries): Do not use `org-entry-get' to
get the "APPT_WARNTIME" property value.

* org-agenda.el (org-agenda-get-timestamps)
(org-agenda-get-sexps, org-agenda-get-deadlines)
(org-agenda-get-scheduled): Ditto.

org.el (org-adaptive-fill-function): Fix checking of post-affiliated

* org.el (org-adaptive-fill-function): Fix checking of
post-affiliated.
(org-id-link-to-org-use-id): Fix compiler warning.

org-depend.el (org-depend-trigger-todo): Refresh effort text properties

* org-depend.el (org-depend-trigger-todo): Refresh effort text
properties.  Do not use `org-get-effort' for getting the
effort property value.

New defun `org-refresh-effort-properties'

* org-agenda.el (org-agenda-format-item): Do not use
org-get-effort to get the effort text property.
(org-agenda-get-sexps): Use `org-back-to-heading' when setting
the tags.

* org-clock.el (org-clock-in): Refresh effort properties.

* org.el (org-refresh-effort-properties): New defun.
(org-get-effort): Delete.
(org-set-effort): Set the 'org-effort text property.
(org-property-next-allowed-value): Ditto.
(org-agenda-prepare-buffers): Refresh effort properties.

Compatibility: Use org-define-obsolete-{function,variable}-alias

* lisp/org-compat.el (org-define-obsolete-function-alias,
  org-define-obsolete-variable-alias): Introduce new compatibility
  macros to obsolete functions and variables.

* lisp/org-agenda.el, lisp/org-clock.el, lisp/org-id.el,
  lisp/org-lparse.el, lisp/org-protocol.el lisp/org.el: Use
  `org-define-obsolete-{function,variable}-alias´instead of
  `define-obsolate{function,variable}-alias´.

Compatibility: Define face alias mode-line for XEmacs

* lisp/org-faces.el: Define face alias mode-line for XEmacs (it's
  called modeline there).

Compatibility: Use org-no-warnings

* contrib/lisp/org-e-odt.el (org-e-odt-htmlfontify-string): Use
  compatibility alias `org-no-warnings´.

Backport patch from revno#r111145 from the Emacs-24 branch

org.texi (Pushing to MobileOrg): Mention that `org-directory' should not contain symbolic links

* org.texi (Pushing to MobileOrg): Mention that `org-directory'
should not contain symbolic links.

Thanks to James Harkins for reporting this problem.

Merge branch 'maint-agenda-optimization' into maint